Η υποστελέχωση των νοσοκομείων αποτελεί ένα από τα σοβαρότερα προβλήματα του Εθνικού Συστήματος Υγείας, με ιδιαίτερα έντονες συνέπειες στην Κρήτη και τα νησιά. Στο Γενικό Νοσοκομείο Χανίων, οι Παθολογικές Κλινικές λειτουργούν σε οριακό σημείο, με μόλις τέσσερις ειδικευμένους γιατρούς σε 12 οργανικές θέσεις, καλύπτοντας το 33% των προβλεπόμενων θέσεων. Το νοσοκομείο δεν μπορεί να καλύψει τις εφημερίες επιμελητών στο Τμήμα Επειγόντων Περιστατικών λόγω υποστελέχωσης και δεν διαθέτει σύστημα διαλογής (triage) σε καθημερινή βάση.
Οι οργανικές θέσεις των ιατρών κλάδου ΕΣΥ αφορούν θέσεις ειδικευμένων ιατρών, και η κάλυψή τους γίνεται μέσω προκηρύξεων. Ο διοικητής του νοσοκομείου Χανίων έχει ζητήσει να ενταχθεί το νοσηλευτικό ίδρυμα στις άγονες υγειονομικά περιοχές, με σκοπό να δοθούν οικονομικά κίνητρα σε γιατρούς του ΕΣΥ. Κενές παραμένουν θέσεις για ογκολόγους στο νοσοκομείο Χανίων, καθώς οι προκηρύξεις δεν συνάντησαν ανταπόκριση λόγω του υψηλού κόστους ζωής και των ακριβών ενοικίων.
Η υποστελέχωση όχι μόνο ταλανίζει το ΕΣΥ, αλλά φαίνεται ότι θα αποτελεί πρόβλημα για πολλά χρόνια ακόμα. Η στελέχωση του Γενικού Νοσοκομείου Χανίων δεν αποτελεί μόνο ζήτημα υγειονομικής πολιτικής, αλλά ζήτημα αναπτυξιακής στρατηγικής για ολόκληρη τη Δυτική Κρήτη.
